تم إنشاء معهد المراقبة الجوية والدراسات الأكاديمية عام 1991 ليكون أول معهد من نوعه فى الشرق الأوسط وأفريقيا يقوم بتخريج المراقبين الجويين المؤهلين بعد دراسة لمدة أربع سنوات يمنح بعدها الخريجين درجة البكالوريوس فى العلوم الجوية.

تمت معادلة درجة البكالريوس التى يمنحها المعهد بدرجة البكالريوس التى تمنحها الجامعات المصرية بقرار المجلس الاعلى للجامعات رقم 30 بتاريح 82/4/2004 .

يعتبر المعهد أحد ثلاثة معاهد على المستوى الدولى التى تمنح الدرجة العلمية.

يتم تعيين خريجى المعهد ضباط للمراقبة الجوية وذلك وفقا للإتفاق الموقع بين هيئة المعهد القومى للتدريب على الطيران المدنى والشركة المصرية القابضة للطيران المدنى بتاريخ 26/6/1991 والمعتمدة من السيد وزير النقل.

ينظم المعهد دراسات عليا دبلوم ، ماجستير فى تطبيقات الأقمار الصناعية فى الملاحة والأرصاد الجوية.

يجرى حاليا تطوير المعهد وتزويده بأحدث المعدات التدريبية المتوافقة مع نظم الملاحة وإدارة الحركة الجوية بالأقمار الصناعية ليكون على قمة المعاهد العالمية المتخصصة فى هذا المجال.